تأسس نادي الداخلية عام 2005 ويتبع وزارة الداخلية المصرية، ونجح في الصعود إلى الدوري المصري الممتاز لأول مرة في موسم 2011–2012. قدم الفريق مستويات مستقرة في عدة مواسم بالممتاز، وارتبط اسمه بالانضباط التكتيكي والاعتماد على العناصر الشابة.
تنقل النادي بين الدوري الممتاز ودوري الدرجة الثانية خلال السنوات الماضية، وسعى دائمًا للعودة إلى المنافسة في أعلى مستوى من الكرة المصرية.
